這兩者本來并不沖突，網站建設面向營銷其本意是讓網站取得更好的營銷效果，這在本質上與網站采用什么技術并不相關。但是事情總是會受到客觀環境制約的，比如說現在的帶寬質量并不允許網站上大量的運用動畫技術。專業做網站的公司都會知道，韓國的網站建設向來以大圖和大幅動畫運用擅長，而且也因為這個讓韓國的網站設計自稱一體，成為很多人網站設計時模仿的對象。需要特別提醒的是，是中國的國情畢竟不一樣，在平均2M的帶寬速率下，網站設計想要媲美韓國，多少有些缺乏自知之明。
一、動畫導入頁面有礙用戶體驗
網站上大幅運用動畫，帶來不佳的用戶體驗，帶寬速率質量太差是一個很重要的方面。但是還有一個不能忽視的情況是，中國網民的計算機水平普遍有待提高。雖然很多人都會使用電腦，但是電腦在某種意義上說還停留在一個超級游戲機上，并沒有真正的發揮作用。網站設計者為了追求炫動效果，而過多的讓網站做的更個性，但是卻忽視了用戶的認知和感受，這樣做的結果是網站做好了，但是營銷效果卻很差。動畫加載完畢后根本不知道如何點擊進入到內頁面。
二、搜索引擎無法識別動畫內容
這不是一個小問題，基于現在的搜索技術，根本無法識別搜索動畫里面的內容。但是既然是營銷型網站，就必定不能忽視搜索引擎的存在。想一下就知道，在搜索引擎應用深入人心的現在，誰還會愿意記憶冗長的網址呢？大多數都是通過搜索引擎關鍵詞檢索一下，然后輕輕點擊鼠標就可以打開目標網頁。所以上海網站制作首選品牌引航科技認為，動畫應用和搜索引擎營銷兩者之間就是存在不可調和的矛盾。如果做一個營銷型網站，而且在搜索引擎上獲得不錯的排名和流量，那么就請重視搜索引擎的感受，而盡可能少的使用FLASH技術吧。
三、動畫網站維護仍有相當難度
不同于網站的文章內容，通過在富文本編輯器里面隨便敲擊，然后只要稍許編輯排版就可以。部分公司缺乏專業的圖文制作人員，而絕大多數公司缺乏動畫制作人員。所以，成創網絡認為，過多的在企業網站制作中運用動畫技術，所帶來的后果是很多公司無法維護。因為無論是多么強勁的網站內容管理系統，指望著編輯Flash動畫都是不現實的。而一個網站缺乏必要的維護更新，時間久之，其吸引力和營銷力肯定會逐漸衰弱，這與營銷型網站建設的本質是相悖的。